水产品的养殖生产过程中使用的药物种类繁多，一些药物对人体健康具有明确的毒害作用，因此也被国家列为重点监测的对象。
1、水产品中的药物残留及检测标准孔雀石绿
孔雀石绿(Malachite green,MG)属于三苯甲烷类染料，具有较强的抗菌效力。曾作为驱虫剂和杀菌剂，广泛用于水产养殖业中，以防治鱼类的水霉病、鳃霉病以及小瓜虫病等。孔雀石绿因其致癌性，已被禁止使用。目前，孔雀石绿及其代谢产物的标准检测方法主要为高效液相色谱法(HPLC)和HPLC-MS/MS、GB/T19857-2005高效液相色谱串联质谱法。氯霉素
氯霉素(Chloramphenicol,CAP)作为一种抗生素，在水产养殖中能有效防治烂鳃、赤皮病等，具有良好的广谱抗菌效果。氯霉素的毒性较大，可造成人体过敏反应，抑制骨髓造血机能、引发不可逆的再生性障碍贫血等疾病。
水产品中氯霉素残留量的测定方法较多，其中酶标法可用于氯霉素的快速筛查测定(农业部1025号公告-26-2008)，HPLC-MS/MS和气相色谱质谱联用法GC-MS和可用于GB/T 22338-2008氯霉素的准确测定。磺胺类
在水产养殖中主要用于治疗鱼、虾、蟹、鳖等动物的细菌性疾病，防治鲤的赤鳍病，香鱼、虹鳟等的弧菌病等。HPLC和HPLC-MS/MS是检测磺胺类药物残留的主要方法。
喹诺酮类
喹诺酮类药物(Quinolones,QNs)是人工合成的含4-喹诺酮基本结构的抗菌药，如环丙沙星、恩诺沙星、诺氟沙星等。其具有抗菌谱广、抗菌活性强的特点，在水产等养殖中广泛用于鱼、虾、蟹等的疾病防治。喹诺酮类药物的种类也较多，因此适用HPLC-MS/MS方法进行检测，如GB/T 20366-2006。
硝基呋喃类代谢物
硝基呋喃类药物是一类化学合成的广谱抗菌药物，曾广泛用于水产等动物传染性疾病的预防与治疗。
硝基呋喃类药物在生物体内代谢迅速，难以原药的形式检出;因此主要是对其代谢产物进行测定，包括呋喃它酮的代谢物5-吗啉甲基-3-氨基-2-噁唑烷基酮(AMOZ)、呋喃西林的代谢物氨基脲(SEM)、呋喃妥因的代谢物1-氨基-2-内酰脲(AHD)和呋喃唑酮的代谢物3-氨基-2-噁唑烷基酮(AOZ)。这些代谢物通常需要以2-硝基苯甲醛进行衍生化，用HPLCMS/MS方法进行测定(GB/T 21311-2007[13]、GB/T 20752-2006[14])。
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